Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STRCQ7RTU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
STRCQ7RTU9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms