Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTF1AQ7RTS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTF1AQ7RTS3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms