Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BBS12Q6ZW61 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms