Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXIP1Q6ZW49 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms