Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CAPN12Q6ZSI9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms