Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLCO4C1Q6ZQN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms