Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRSAM1Q6UWE0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRSAM1Q6UWE0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms