Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM88Q6PEY1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms