Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A1Q6PCB7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A1Q6PCB7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms