Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMOD2Q6P5Q4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms