Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NEPROQ6NW34 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEPROQ6NW34 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms