Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNDC8Q6A555 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNDC8Q6A555 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNDC8Q6A555 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TXNDC8Q6A555 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TXNDC8Q6A555 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNDC8Q6A555 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TXNDC8Q6A555 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms