Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPECC1LQ69YQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms