Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD2Q68DH5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD2Q68DH5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms