Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CHIC1Q5VXU3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CHIC1Q5VXU3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms