Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP350Q5VT06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP350Q5VT06 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms