Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC183Q5T5S1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms