Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC122Q5T0U0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC122Q5T0U0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms