Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHSL1Q5SYE7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHSL1Q5SYE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms