Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC39AQ5SRH9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC39AQ5SRH9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms