Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPANXN4Q5MJ08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPANXN4Q5MJ08 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms