Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITRM1Q5JRX3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PITRM1Q5JRX3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms