Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFT2D3Q587I9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms