Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP55Q53EZ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP55Q53EZ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms