Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SYTL3Q4VX76 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms