Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN3Q4LDR2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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