Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIK1Q3SY52 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms