Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC57Q2TAC2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms