Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSR1Q2NL82 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSR1Q2NL82 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms