Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTN1Q16799 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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