Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK4Q16654 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK4Q16654 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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