Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP3Q15836 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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VAMP3Q15836 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VAMP3Q15836 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP3Q15836 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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