Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEBPEQ15744 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEBPEQ15744 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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