Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NFKBIBQ15653 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIBQ15653 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms