Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCF4Q15080 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCF4Q15080 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCF4Q15080 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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NCF4Q15080 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NCF4Q15080 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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