Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERC3Q15034 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERC3Q15034 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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