Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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COL19A1Q14993 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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COL19A1Q14993 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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COL19A1Q14993 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL19A1Q14993 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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COL19A1Q14993 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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COL19A1Q14993 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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COL19A1Q14993 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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COL19A1Q14993 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL19A1Q14993 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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