Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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