Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RUNX2Q13950 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms