Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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