Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF9Q13886 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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