Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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