Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF4BQ13523 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF4BQ13523 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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