Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BFSP2Q13515 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BFSP2Q13515 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms