Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P3Q13401 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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PMS2P3Q13401 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PMS2P3Q13401 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PMS2P3Q13401 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PMS2P3Q13401 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PMS2P3Q13401 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PMS2P3Q13401 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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