Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RESTQ13127 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RESTQ13127 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RESTQ13127 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RESTQ13127 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RESTQ13127 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RESTQ13127 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RESTQ13127 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RESTQ13127 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RESTQ13127 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RESTQ13127 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RESTQ13127 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RESTQ13127 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RESTQ13127 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RESTQ13127 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RESTQ13127 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RESTQ13127 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RESTQ13127 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RESTQ13127 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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