Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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TRAF3Q13114 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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TRAF3Q13114 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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TRAF3Q13114 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAF3Q13114 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAF3Q13114 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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