Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK3Q13003 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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