Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN13Q12923 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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