Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TP53BP1Q12888 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms